O Palácio Bom Conselho tem sofrido seguidas derrotas no Tribunal de Contas do Estado (TCE). No dia 9 de setembro, após análise da matéria, a equipe técnica do TCE constatou a existência de falhas e/ou impropriedades capazes de inviabilizar o contrato assinado entre a Prefeitura de Taubaté e a empresa Suporte Serviços de Segurança Ltda no dia 24 de maio de 2011 para a prestação de serviços de segurança pessoal e patrimonial privada, armada e equipada. Os palacianos têm 30 dias para adotar as providências necessárias ao exato cumprimento da lei ou apresente justificativas acerca das dúvidas suscitadas.
Já no dia 12 de setembro, o TCE aplicou multa de 100 UFESP´s por descumprimento de uma determinação do Tribunal, que exigiu a remessa de dados no formato exigido no Sistema Audesp referentes ao exercício de 2010.